Het Baikalgebergte is te situeren ten noordwesten van het Baikalmeer in het zuiden van Siberië in Rusland. Het ligt in het oosten van het Midden-Siberisch Bergland, waar het samen met de oostelijke Sajan de zuidelijke grens vormt. In het noordoosten gaat het gebergte over in het Stanovojgebergte. Het hoogste punt is de Tsjerskogo met een hoogte van 2572 meter.
De Lena ontspringt in het Bajkalgebergte. Er groeien bomen als de witte els, ratelpopulier, zachte berk, Siberische lariks, Siberische zilverspar (abies sibirica), grove den en Siberische spar (picea obovata).